「自十一月十三日起，我们反学园都市『科学护卫』的廿七间企业将于东欧的巴盖吉城，举办格斗大会『天择者』」——
就从这项声明开始，
以第三次世界大战为契机，
反学园都市势力在各地摸索着各种形式的抵抗运动。
这场「天择者」比赛，目的是透过淘汰制的异种格斗大会，
以「证明凌驾超能力的『异能』」。
完全就是想从根本上将学园都市破坏。
他们借由融合魔法与科学的组织「捣蛋鬼」之手，来推动这项谋略。
然后——
学园都市绝不容许如此的行为。
这是由双方各为仅有三人的「木原」与「捣蛋鬼」，
所引发的一发不可收拾，最为糟糕的骚动。
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