10月30日。第三次世界大战开战后，已经过了十一天。三名少年各怀心思，冲进战火弥漫的俄罗斯。
前「道具」的小喽啰滨面仕上，为了治疗泷壶理后四处奔走，可惜却苦无线索。解决的关键在于他遇见的前「神之右席」圣人后方之水。
最强的等级5超能力者一方通行，在经过与最弱的强敌鏖战后，被移送到伊利沙里纳独立国同盟。他依然遍寻不着解救最后之作的方法。解决的关键在于上头记载着魔法的神秘羊皮纸。
而上条当麻终于遇见了右方之火，却也是因为对方手下留情，才有机会逃走获救。然而他至今还无法让茵蒂克丝恢复原状。解决的关键在于人称「天使」的异次元居民。
他们三人怀着三种想法，当科学与魔法交会时，故事就此开始──！
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